本片讲述相传女娲补天时七彩神石中有一颗遗落于不周山脉南部的一座峰峦之巅，女娲座下灵狐一族则被派遣下界守护神石的故事，天地混沌，万物伊始，水火二神为夺天帝之位大战，共工怒触不周山，故天倾西北，月转星移。

首次以三维动画形式讲述花木兰故事，故事基于原著但作了合理改编，木兰从小怀抱女侠梦想，可在替父从军后屡次遭受打击，咬牙坚持下面对爱情和友情种种，最终真正理解了“侠之大者，为国为民”的含义。

抗美援朝战争结束后，曾经立下赫赫战功的冯石将军（李雪健 饰）接到中央委派的重要使命，那就是主持原子弹的研发工作。然对原子弹一窍不通，但是军人出身的冯石只有服从上级的命令。